問題解答|ADMET Predictor預(yù)測模型的外部預(yù)測準(zhǔn)確性
是否有第三方獨(dú)立評估過ADMET Predictor軟件外部預(yù)測的準(zhǔn)確性,其結(jié)果如何?應(yīng)當(dāng)怎樣合理使用這些預(yù)測參數(shù)來評估化合物的PK和安全性?
答:
大多數(shù)情況下,ADMET Predictor的預(yù)測值較為準(zhǔn)確,足以對大量化合物進(jìn)行排序(優(yōu)劣)。前30%的化合物始終優(yōu)于后30%的化合物,因此可用于盡早淘汰成藥性差的化合物,減少浪費(fèi)時(shí)間和精力;
溶解度:使用4000個(gè)化合物評估了不同軟件的溶解度預(yù)測準(zhǔn)備性,ADMET Predictor在同類軟件中預(yù)測結(jié)果準(zhǔn)確排名靠前(Sci Total Environ. 2013 Oct 1; 463-464:781-9.);
LogP:來自輝瑞和奈科明制藥公司96000多個(gè)化合物的數(shù)據(jù)比較了logP的預(yù)測準(zhǔn)確性,ADMET Predictor預(yù)測準(zhǔn)確性屬于第一系類(J Pharm Sci. 2009 Mar; 98(3): 861-93.)
LogP和pKa:比較強(qiáng)生ADME毒理部門發(fā)表的文章中50個(gè)化合物的logP和pKa的實(shí)測數(shù)據(jù)與ADMET Predictor預(yù)測的數(shù)據(jù),預(yù)測數(shù)據(jù)與實(shí)測數(shù)據(jù)非常接近;
毒性(黑頭呆魚LD50):使用567個(gè)化合物比較了8款軟件對黑頭呆魚LD50的預(yù)測準(zhǔn)確性,ADMET Predictor可較為準(zhǔn)確的預(yù)測,R2=0.85 (SAR QSAR Environ Res. 2015 Dec; 26(12): 977-999.)
此外,軟件所有定性的預(yù)測結(jié)果還可查看預(yù)測結(jié)果的可信度(以%表示,如下圖左),數(shù)值越大,代表預(yù)測結(jié)果的可信度越大,準(zhǔn)確性越高。如果預(yù)測結(jié)果以紅色字體表示(如下圖右),則表明結(jié)果超出了預(yù)測范圍(超出訓(xùn)練集范圍),預(yù)測準(zhǔn)確性的置信度較低。