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ADMET Predictor 軟件操作與應(yīng)用常見問題與解答
本文整理了ADMET Predictor軟件操作與應(yīng)用時,常遇到的問題與對應(yīng)的解答
2021年02月07日
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問題解答|ADMET Predictor軟件電子說明書的獲取及內(nèi)容簡介
ADMET Predictor的電子版說明書,可以在軟件的安裝路徑下,默認路徑為C:\ProgramData\Simulations Plus, Inc\ADMET_Predictor10.2,查找該路徑下”ADMET_Predictor_···
2021年07月20日
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問題解答|ADMET Predictor預(yù)測模型的原始數(shù)據(jù)來源與數(shù)量等相關(guān)問題
ADMET Predictor內(nèi)建的性質(zhì)預(yù)測模型,建模數(shù)據(jù)來源于哪里,搭建該模型的化合物的數(shù)量有多少,包括哪些結(jié)構(gòu)?答:ADMET Predictor軟件可以預(yù)測包括理化、代謝、毒性、體內(nèi)PK等相關(guān)的150多個性質(zhì)參數(shù),所有的性質(zhì)參數(shù)預(yù)測?!ぁぁ?
2021年01月30日
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問題解答|查看ADMET Predictor內(nèi)建模型的預(yù)測誤差
如何查看ADMET Predictor某個模型的預(yù)測誤差?答:將光標(biāo)直接放到對應(yīng)的參數(shù)上即可查看該模型的整體準確性(如下圖),準確性指標(biāo)包括RMSE/MAE (均方根誤差/平均絕對誤差)或Overall accuracy:定量預(yù)測模型的RM···
2021年01月29日
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問題解答|ADMET Predictor預(yù)測模型的外部預(yù)測準確性
大多數(shù)情況下,ADMET Predictor的預(yù)測值較為準確,足以對大量化合物進行排序(優(yōu)劣)。前30%的化合物始終優(yōu)于后30%的化合物,因此可用于盡早淘汰成藥性差的化合物,減少浪費時間和精力
2021年01月28日
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問題解答|如何拓展內(nèi)建模型的預(yù)測范圍和化合物結(jié)構(gòu)的多樣性
目前ADMET Predictor僅支持拓展定量預(yù)測的模型,無法拓展定性預(yù)測的模型,而且需要具備自建模型模塊和準備拓展的模型模塊;舉例:hERG Filter模型為定性預(yù)測模型,不支持用戶拓展該模型;hERG pIC50模型為定量預(yù)測模型,···
2021年01月27日
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問題解答|基因毒性預(yù)測模型是否滿足法規(guī)要求
我國于2017年加入ICH,目前中國國家食品藥品監(jiān)督管理總局制訂發(fā)布的許多技術(shù)指導(dǎo)原則在起草過程中不同程度地參考了ICH相關(guān)指導(dǎo)原則,在內(nèi)容和技術(shù)要求上與ICH技術(shù)指導(dǎo)原則較為接近
2021年01月26日
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問題解答|如何理解參數(shù)介紹文件中括號含義
中括號[ ] 表示“軟”閾值,以 Peff 風(fēng)險系數(shù)為例:若 S+Peff< 0.25,違反該打分規(guī)則,風(fēng)險系數(shù)為1;0.25 ≤ S+Peff≤ 0.5,也違反該打分規(guī)則,但風(fēng)險險系數(shù)在0和1之間
2021年01月25日
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問題解答|“S+性質(zhì)”代表什么意思
“S+”代表:Simulations Plus公司,即ADMET Predictor軟件開發(fā)商。以“S+性質(zhì)”的形式呈現(xiàn),是為了說明模型中的參數(shù)是Simulations Plus公司搭建的或采用該公司的自有算法的;而無“S+”表示非該公司的···
2021年01月24日
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問題解答|預(yù)測結(jié)果中圖形與顏色的含義
餅狀圖為統(tǒng)計結(jié)果,每個扇形代表一種性質(zhì),顏色沒有任何含義,只是便于區(qū)分不同的性質(zhì)。扇形半徑的長短表示該扇形代表性質(zhì)的大小(定量)或是與非的判斷(定性),詳細信息參考下圖
2021年01月23日